You are hereЧто такое рак почки / Мета-анализ экспресии генов клеток светлоклеточного почечного рака определяет вариантную подгруппу и влияние пола на биологию опухоли

Мета-анализ экспресии генов клеток светлоклеточного почечного рака определяет вариантную подгруппу и влияние пола на биологию опухоли


ИСТОРИЯ:
Светлоклеточный рак почки (СКРП) демонстрирует молекулярную и гистологическую неоднородность. Ранее описанные подвиды этого заболевания, А и В, были определены на основе профилей мультигенной экспресии, но неясно, отражает ли это деление весь спектр разновидностей и как эти молекулярные подтипы связаны с гистологическими вариантами или полом.

ЦЕЛЬ:

Определить, существуют ли дополнительные подтипы светлоклеточного рака почки и связаны ли эти подтипы с инактивацией фон Хиппель-Линдау (VHL), гипоксия-индуцируемым фактором (HIF) 1 и 2 экспрессии, а также с гистологией опухоли или полом.

Дизайн, установки и участники:

Были идентифицированы шесть больших, общедоступных баз данных экспрессии генов светлоклеточного рака почки, что кумулятивно предоставило данные на 480 опухолей для мета-анализа с помощью компиляции мета-массива

Измерения:

Мета-массив был подвергнут неконтролируемому кластерному консесусу. Опухоли были изучены на предмет взаимосвязи между подтипами мультиген-определенного консенсуса и экспрессией подписи VHL мутации и HIF статуса, гистологией опухоли и полом.

Результаты и ограничения:

Наблюдались два доминирующих подмножества светлоклеточного рака почки. Тем не менее, меньший третий кластер сильно коррелировал с VHL профилем экспрессии «дикого» типа (wild type) и признаками вариантной гистологии. После удаления вариантной гистологии, опухоли группы А естественно распределились по половому признаку. Этот метод ограничен потенциально стойким групповым эффектом, погрешностью отбора опухолей, а также ограничениями аннотированной информации.

ВЫВОДЫ:

Подмножества светлоклеточного рака почки А и В устойчивы в мета-анализе среди гистологически обычных светлоклеточных раков почки. Третья группа опухолей может представлять собой новый вариант светлоклеточного рака почки. Связь вида опухоли с полом может в значительной мере определять варианты лечения и разработку препаратов.